Browsing tag: biofilm

Mikrobiom liści roślin uprawnych

The microbiome on the leaves of crop plants
K. Kucharska, U. Wachowska
27 July 2017

1. Wstęp. 2. Liść jako siedlisko mikroorganizmów. 3. Społeczności mikroorganizmów na liściach. 4. Mikrobiom. 5. Pozytywne oddziaływanie mikroorganizmów na rośliny. 6. Negatywne oddziaływanie mikroorganizmów na rośliny. 7. Struktura zbiorowisk mikroorganizmów zasiedlających liście. 8. Techniki badawcze zbiorowisk mikroorganizmów zasiedlających liście. 9. Podsumowanie

Abstract: The leaves of crop plants are colonized by numerous microorganisms which live on leaf surface or penetrate into the tissues, despite nutrient deficiencies and exposure to adverse environmental conditions. Leaf-colonizing microorganisms exhibit a broad range of relationships with the host plant, thus forming a complex interactive ecosystem. The functions of microbial communities and their effects on the host plant have not been fully elucidated to date. Expanding our knowledge in this area can have important practical implications, including more effective pathogen and disease control. Rapidly developing molecular techniques can provide valuable information about the interactions between microbes and the host plants they colonize. The aim of this study was to characterize microorganisms colonizing the leaves of crop plants, and to discuss the benefits and threats related to their presence in this ecological niche.

1. Introduction. 2. Leaf as habitation of microorganisms. 3. Community of microorganisms on the leaves. 4. The microbiome. 5. Positive interaction of microorganisms on plants. 6. Negative interaction of microorganisms on plants. 7. Structure of microorganism communities colonizing leaves. 8. Techniques of study microorganism communities colonizing leaves. 9. Summary

Autor: Postępy Mikrobiologii
No Comment
Czytaj dalej

Bakteriofagi i drapieżniki bakterii jako czynniki limitujące liczbę bakterii w środowisku

Bacteriophages and bacterial predators as agents limiting the amount of bacteria in the environment
A. Wierzbicka-Woś, W. Deptuła
26 July 2017

1. Wprowadzenie. 2. Bakteriofagi a bakterie w środowisku. 3. Bakterie drapieżne z grupy BALO a bakterie w środowisku. 4. Pierwotniaki a bakterie w środowisku. 5. Drapieżniki bakterii a biofilm. 6. Mechanizmy obronne bakterii oraz ich interakcje z drapieżnikami. 7. Praktyczne wykorzystanie drapieżników bakterii. 8. Podsumowanie

Abstract: Bacterial predators, such as Bdellovibrio and Bdellovibrio like organisms (BALOs), protozoa and bacteriophages, are the major cause of bacterial mortality. Howeverthe correlations between these microorganisms enable their coexistance in the same ecological niche. This review presents the interactions between bacterial prey and their predators, and bacteriophages. In addition, it describes bacterial adaptations helping bacteria to prevent the attack. Taking into account current problems with increasing antibiotic resistance of pathogenic microorganisms, this observations can lead us to the discovery of novel antimicrobial compounds, which are common in nature, and could be used in the future against animal and human pathogens. Moreover, these microorganisms might be also a potentialsource of novel biocatalysts, which could be applied in biotechnological processes.

1. Introduction. 2. Bacteriophages and bacteria in the environment. 3. Bacterial predators from BALO and bacteria in the environment. 4. Protozoa and bacteria in the environment. 5. Bacterial predators and biofilm. 6. Defense mechanisms of bacteria and their interactions with predators. 7. Practical use of bacterial predators. 8. Summary

Autor: Postępy Mikrobiologii
No Comment
Czytaj dalej

Zakażenia w ortopedii związane ze stosowaniem biomateriałów

Orthopedic surgery infections related to the use of biomaterials
J. Nowicka, M. Bartoszewicz
20 July 2017

1. Wstęp. 2. Zakażenia związane z wytwarzaniem biofilmu. 3. Czynniki ryzyka powikłań infekcyjnych związane ze stosowaniem biomateriałów. 3.1. Czynniki związane z pacjentem. 3.2. Czynniki związane z zabiegiem operacyjnym. 4. Podział zakażeń wokół implantów. 5. Najczęstsze czynniki etiologiczne zakażeń związanych ze stosowaniem biomateriału. 5.1. Staphylococcus aureus, Staphylococcus epidermidis i inne CNS. 5.2. Pseudomonas aeruginosa. 5.3. Propionibacterium acnes. 5.4. Streptococcus pyogenes. 5.5 Candida albicans. 6. Rozpoznanie infekcji związanych ze stosowaniem biomateriałów. 7. Profilaktyka antybiotykowa okołooperacyjna. 8. Podsumowanie

Abstract: In spite of recent advances in diagnostics and therapy, muscoskeletal infections still remain a huge problem. Etiological agents of infections associated with the use of biomaterials on orthopedic and surgical orthopedic wards are often the microbes included in the patient’s own flora and these commonly found in hospitals. The present paper discusses the risk factors and most common etiological agents of these types of infections.

1. Introduction. 2. Infections associated with biofilm formation. 3. Risk factors for complications following biomaterial-related infections. 3.1. Patient-related factors. 3.2. Surgical procedure-related factors. 4. Infections classified with regard to implants. 5. The most common etiological agents of infections associated with the use of biomaterial. 5.1. Staphylococcus aureus, Staphylococcus epidermidis and other CNS. 5.2. Pseudomonas aeruginosa. 5.3. Propionibacterium acnes. 5.4. Streptococcus pyogenes. 5.5 Candida albicans. 6. Detection of biomaterial-associated infections. 7. Perioperative antibiotic prophylaxis. 8. Summary

Autor: Postępy Mikrobiologii
No Comment
Czytaj dalej

Mechanizmy oporności Acinetobacter baumannii na związki przeciwbakteryjne

Acinetobacter baumannii: mechanisms of resistance to antibacterial agents
A. Namysłowska, A. E. Laudy, S. Tyski
20 July 2017

1. Wstęp. 2. Oporność na antybiotyki β-laktamowe. 2.1. Enzymy CHDL. 2.2. Enzymy MBL. 2.3. Karbapenemazy należące do klasy A wg Amblera. 2.4. Nabyte enzymy ESβL hamowane przez inhibitory β-laktamaz. 2.5. Enzymy AmpC. 3. Oporność na antybiotyki inne niż β-laktamy. 3.1. Oporność na chinolony i fluorochinolony. 3.2. Oporność na aminoglikozydy. 3.3. Oporność na kolistynę. 4. Aktywne usuwanie antybiotyków z komórki bakteryjnej przy udziale pomp błonowych – mechanizm efflux. 4.1. System pomp RND. 4.2. Inne systemy pomp błonowych. 5. Kanały błonowe – pory. 6. Biofilm i zjawisko quorum sensing. 7. Podsumowanie

Abstract: Acinetobacter baumannii has become one of the most dangerous Gram-negative bacterial species, causing numerous infections over the last 20 years. A. baumannii is responsible for nosocomial ventilator-associated pneumonia (VAP), urinary tract infections, meningitidis and bacteremia. Its remarkable ability to acquire resistance determinants against multiple antibiotics of different classes and to tolerate harsh environments resulted in the dissemination of multi-drug-resistant (MDR) strains. Diverse mechanisms of resistance limit therapeutic options and make the infections difficult to treat. The described resistance mechanisms include: production of β-lactamases, i.e. enzymes modifying structure of antibiotics, activity of efflux pumps, loss of membrane porins and formation of biofilm.

1. Introduction. 2. Resistance to β-lactams. 2.1. CHDLs. 2.2. MBLs. 2.3. Ambler class A carbapenemases. 2.4. Acquired ESβLs inhibited by clavulanic acid. 2.5. AmpC enzymes. 3. Resistance to antibiotics other than β-lactams. 3.1. Resistance to quinolones and fluoroquinolones. 3.2. Resistance to aminoglycosides. 3.3. Resistance to colistin. 4. Efflux systems. 4.1. RND efflux system. 4.2. Other efflux systems. 5. Outer membrane porins. 6. Biofilm and quorum sensing process. 7. Summary

Autor: Postępy Mikrobiologii
No Comment
Czytaj dalej

Nowoczesne metody zwalczania biofilmu bakteryjnego

Novel methods of bacterial biofilm elimination
M. Maciejewska, M. Bauer, M. Dawgul
3 July 2017

1. Wstęp. 2. Etapy powstawania biofilmu, a oporność na antybiotyki. 3. Strategie zapobiegania tworzenia się biofilmu. 3.1. Celowanie w początkową fazę rozwoju biofilmu. 3.1.1. Związki niskocząsteczkowe (Small Molecules). 3.1.2. Ingerencja w quorum sensing. 3.1.3. Przeciwciała. 3.1.4. Biofilm drobnoustrojów niepatogennych. 3.2. Modyfikacja biomateriałów w celu zwiększenia ich odporności na adhezję drobnoustrojów. 3.2.1. Materiały antyadhezyjne. 3.2.2. Powłoki bakteriobójcze/bakteriostatyczne. 4. Metody eradykacji biofilmu. 4.1. Fizyczne metody eradykacji biofilmu. 4.2. Biologiczne metody eradykacji biofilmu. 4.3. Chemiczne metody eradykacji biofilmu. 5. Peptydy przeciwdrobnoustrojowe. 6. Podsumowanie

Abstract: Bacterial biofilm is defined as a sessile, tridimensional microbial community composed of bacteria immersed in a polysaccharide matrix. The structures can grow on human tissues or medical devices resulting in biofilm related infections, which are very often impossible to treat with the commonly used antibiotics. Due to their resistance to the conventional antimicrobial therapy, efficient methods of treatment as well as prophylaxis need to be developed.
Biofilm formation can be reduced by inhibiting the process of adhesion and by interfering with quorum sensing system. Very promising is also the application of appropriate antibodies or use of non-pathogenic bacterial strains. Another approach focuses on the surface modifications in order to obtain the resistance to microbial colonization.
Disruption of mature structures can be achieved by several physical, chemical and biological methods. The novel approaches, which are currently being under intensive investigation, include: phage therapy, matrix targeting enzymes, photodynamic therapy and antimicrobial peptides. The above-mentioned strategies are described in the presented work with a special focus on antimicrobial peptides as the potential tool for prophylaxis as well as elimination of mature biofilms.

1. Introduction. 2. Stages of biofilm formation and the resistance to antibiotics. 3. Strategies of prevention of biofilm formation. 3.1. Targeting the initial phase of biofilm formation. 3.1.1. Small Molecules. 3.1.2. Interference in quorum sensing. 3.1.3. Antibodies. 3.1.4. Biofilm of non-pathogenic microorganisms. 3.2. Modification of biomaterials for increased resistance to microbial adhesion. 3.2.1. Anti-adhesive materials. 3.2.2. Bacteriostatic/bactericidal coatings. 4. Methods for biofilm eradication. 4.1. Physical methods for biofilm eradication. 4.2. Biological methods for biofilm eradication. 4.3. Chemical methods for biofilm eradication. 5. Antimicrobial peptides. 6. Conclusions

Autor: Postępy Mikrobiologii
No Comment
Czytaj dalej
1 2 3 4 5

Current Issue

Current Issue

Advancements of Microbiology
Volume 64 (2025): Issue 4

Publisher

PTM

Publisher